Vokietija – Įvairūs vertinimo arba tyrimo prietaisai – Arrays & Chemikalien für NAKO-Genotypisierung
Vokietija – Įvairūs vertinimo arba tyrimo prietaisai – Arrays & Chemikalien für NAKO-Genotypisierung
I dalis: Perkančioji organizacija
I.1) Pavadinimas ir adresai:
Oficialus
pavadinimas: Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH)
Adresas: Ingolstädter Landstrasse 1
Miestas: Neuherberg
Pašto
kodas: 85764
Šalis: Vokietija
Asmuo
ryšiams:
El-paštas: bianca.lander@helmholtz-munich.de
Interneto adresas (-ai):
II dalis: Objektas
II.1.1) Pavadinimas:
Arrays & Chemikalien für NAKO-Genotypisierung
Nuorodos numeris: VgV_2024-007
II.1.2) Pagrindinis BVPŽ kodas:
38900000
Įvairūs vertinimo arba tyrimo prietaisai
II.1.3) Sutarties tipas:
Kita
II.1.4) Trumpas aprašymas:
Die NAKO soll genetisch charakterisiert werden, um die Bearbeitung genetischer Fragestellungen zu ermöglichen. Dafür sollen alle Teilnehmer der Basisuntersuchung mit einem genetischen Array genotypisiert werden, der das Genom ausreichend für eine Imputierung abdeckt und zusätzlich krankheitsspezifische SNPs enthält, die von den entsprechenden Expertengruppen vorgeschlagen werden.
Kerninformation über die Proben innerhalb des NAKO-Projekts
Die NAKO-Gesundheitsstudie (NAKO) ist eine Langzeit-Bevölkerungsstudie. Ein Kernbestandteil der Studie ist die Sammlung von verschiedenen Biomaterialien, deren Verarbeitung, Lagerung, Analyse und Weitergabe zur wissenschaftlichen Auswertung.
Die gesammelten Bioproben (ausschließlich humanes biologisches Material) werden in Cryo-Röhrchen (CR) bei -80 °C (Serum, Buffy Coat, Urin, Speichel, Stuhl, genomische DNA) oder bei -180 °C (Serum, Plasma, Erythrozyten, Urin) gelagert. Die DNA wurde mit der magnetischen Beads Technologie von Perkin Elmer auf dem chemagic Prime 8 System aus den Buffy Coats isoliert. Die isolierten DNA-Proben erfüllen grundsätzlich die Standard-Qualitätskriterien für Reinheit und Ausbeute für eine nachfolgende Chip-basierte Genotypisierung:
(1) DNA-Konzentration und Volumen >20 ng/µl in 400 µl (99,8%),
(2) Absorptionsverhältnis 260/280 nm >1,8 und <2,0 (99,8%),
(3) Absorptionsverhältnis 260/230 nm >1,5 (92,0%).
672 DNA-Proben wurden zusätzlich mittels Gelelektrophorese auf ausreichende Integrität getestet und weisen eine Fragmentgröße von >20kb auf.
Die Genotypisierungsergebnisse (Rohdatensatz und genotyp-gecallter Datensatz nach QC) werden nach einer zusätzlichen bioinformatischen Qualitätskontrolle in die zentrale Datenhaltung überführt und stehen dort nach genehmigtem Antrag allen interessierten Wissenschaftlern zur Verfügung.
II.2) Aprašymas:
II.2.1) Kitas (-i) šio pirkimo BVPŽ kodas (-ai):
38900000 Įvairūs vertinimo arba tyrimo prietaisai